PCR技術(shù)操作流程
一、PCR 的基本原理
類似于 DNA 的體內(nèi)復(fù)制。首先待擴(kuò)增 DNA 模板加熱變性解鏈,隨之將反應(yīng)混合物冷卻至某一溫度,這一溫度可使引物與它的靶序列發(fā)生退火,再將溫度升高使退火引物在 DNA 聚合酶作用下得以延伸。這種熱變性 - 復(fù)性 - 延伸的過(guò)程就是一個(gè) PCR 循環(huán),PCR 就是在合適條件下的這種循環(huán)的不斷重復(fù)。
二、PCR 反應(yīng)體系
1. 緩沖液
標(biāo)準(zhǔn)的緩沖液含 1pmol/ml Tris ·HCl,其 pH 為 8.3-9.0(室溫),而在延伸溫度(72 ℃)下,pH 值接近 7.2 。緩沖液中含有一種二價(jià)陽(yáng)離子,用于激活 DNA 聚合酶的活性中心,一般使用 Mg2+。
2.dNTP
脫氧核糖核苷三磷酸的縮寫,是包括 dATP, dGTP, dTTP, dCTP 等在內(nèi)的統(tǒng)稱,即合成新的 DNA 鏈的材料。4 種 dNTP 的濃度相等,總濃度一般為 200pmol/ml (即飽和濃度)。dNTP 可與 Mg2+ 結(jié)合,使游離的 Mg2+ 濃度下降,影響 DNA 聚合酶的活性。
3. 引物
引物是一段短的單鏈 DNA 片段,可結(jié)合在核酸鏈上與之互補(bǔ)的區(qū)域,其功能是作為核苷酸聚合作用的起始點(diǎn),DNA 聚合酶可由其 3′端開始合成新的核酸鏈。引物長(zhǎng)度一般以 18~30bp 為宜,過(guò)短則降低特異性,過(guò)長(zhǎng)則會(huì)引起引物間的退火而影響有效擴(kuò)增,同時(shí)也增加引物合成的成本。引物的堿基順序不能與非擴(kuò)增區(qū)有同源性。
4. 模板
模板是一段單鏈或者雙鏈 DNA,提供用于進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增的原始信息。對(duì)模板的純度要求低,但不能混有蛋白酶、核酸酶、DNA 聚合酶抑制劑、DNA 結(jié)合蛋白等。模板 DNA 應(yīng)該盡量保持低溫保存。
5.Taq DNA 聚合酶
Taq DNA 聚合酶以 DNA 為復(fù)制模板,從將 DNA 由 5' 端點(diǎn)開始復(fù)制到 3' 端的酶。DNA 聚合酶的主要活性是催化 DNA 的合成(在具備模板、引物、dNTP 等的情況下)及其相輔的活性。必須一直保存于-20℃,內(nèi)含甘油保存。最適反應(yīng)溫度 72 ℃,即延伸溫度。通常在配制 PCR 體系的最后加入。
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