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熒光及可視化 RT-LAMP 擴增試劑盒簡介

來源:上海雅吉生物科技有限公司   2022年08月02日 09:29  

產(chǎn)品及特點

本產(chǎn)品是根據(jù)本公司的雙染料 RT-LAMP 技術(shù)開發(fā)的熒光和可見光雙模式檢 試劑盒 ,它既可以用于熒光 RT-LAMP 擴增及檢測 ,也可以用于可視化 RT-LAMP 擴增及檢 ,適用于各種針對核酸的快速定性檢測。  本產(chǎn)品具有下列特點:

1.   含可光和熒光染料,  既可以用金屬浴和水浴擴增用可見光肉眼判斷結(jié)果 ,也可

用熒光 PCR 儀進行實時熒光檢測。

2.   內(nèi)含的 dUTP-UNG 可防交叉污染。

3.   特異性比 RT-PCR 高,  因為 RT-LAMP 擴增使用 4-6 條引物而不是兩條。

4.   靈敏性可達 10 拷貝/反應以下  (隨引物而不同)  ,故假陰性率更低。

5.   只可用于科研 ,只可進行定性檢測 ,不能用于定量檢測。

規(guī)格及成分

 

   

編號

塑料盒包裝

 

MMLV 逆轉(zhuǎn)錄酶(含 RI),  200UL

60905a

50 μL  (黃蓋)

4 ×RT Buffer  (含 dNTP)

60905b

250 μL  (白蓋)

5 ×熒光及可視化 LAMP MagicMix

200603a

200 μL  (綠蓋)

Bst DNA 聚合酶 2.0  ( 8U/uL)

200403

50 uL (紅蓋)

RT-LAMP 陽性對照模板-引物混合物

130923a

20 μL  (黃蓋)

純水

100935

1mL  (亮黃蓋)

使用手冊

200603sc

1 

運輸及保存

低溫輸,  -20 ℃保存,保存期限為一年。

備試劑

RT-LAMP 模板及 RT-LAMP 引物、PCR 級石蠟油  (僅對使用金屬浴或水浴者)  。

使用方

準備工作:如果使用水浴鍋或金屬浴,  需要在實驗啟動前打開并調(diào)到 60-65℃。如果 用金屬浴,還必須在孔中加水以填充金屬孔和反應管間的空隙。金屬浴和水浴溫控遠 遠不如 PCR 儀器,  所以使用前需要用陽性對照和陰性對照  (水)  做預實驗確認可用。

、  樣品 RNA 的制備

1.  用自選方法純化樣品的 RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù) RNA 提取試劑盒兼容。

2.  如果有 N 個樣品,  則至少需要做 N+2 個樣品制備,  包括一個制備陽性對照(制備

時加入自備的跟要測的靶分子相同的陽性對照模板, 一起經(jīng)歷提取過程) 和一個 陰性對照  (用水替代樣品)。最后 N+2 個樣品一起進行 RNA 提取操作,得

N+2 個 RNA 樣品。

二、  合成 1st-strand cDNA

3.  按下表配制 RT 反應體系:

 

加入

 

 


   

RNA 模板

 RNA

poly(A) mRNA

或?qū)R坏?/span> RNA

注意 RNA 樣品不能有基因組 DNA 污染。

 

 

100-500 ng

10-500 ng

0.01pg-500ng

 

自備引物 F3

1 μL

4 ×RT Buffer  (含 dNTP)

5 μL

RNase-free 

補水到  19 μL

4.  70℃保溫 5 分鐘后立即冰浴。

5.  37℃保 5 分鐘。對富含二級結(jié)構(gòu)的高 GC RNA 模板,可改成 45℃保溫 5 分鐘。

6.  加入 1 μL (=200 U) MMLV 逆轉(zhuǎn)錄酶(含 RI)  ,終體積為 20μL。

7.  42℃保溫 60 分鐘。

8.  70℃保溫  10 分鐘以終止反應,放置在冰上待用。合成的 cDNA 可以直接作為

LAMP 模板使用,不需要純化。

三、   熒光及可視化 LAMP 擴增及檢測  ( 20μL 體系)

9.  應設置:如果有 N+2 個 cDNA 樣品,則最好設置 N+4 個 LAMP 擴增,增加 LAMP

陰性對照和 LAMP 陽性對照各 1 個。在 N+4 個 0.2mL PCR 管中加入下列成分:

 

N+2 

樣品管

LAMP  性對照

LAMP

性對照

5 × 熒 光 及 可 視 化 LAMP MagicMix

4 μL

4 μL

4 μL

20×引物混合液

 1 μL

1 μL

-

N+2 個樣品cDNA

最多 14 μL

-

-

RT-LAMP 陽性對照 模板-引物混合物

 

-

 

-

15 μL

Bst DNA 合酶 2.0

 1 μL

1 μL

 1 μL

純水

 

14 μL

-

 

10. 混勻后進行擴增。由于本產(chǎn)品含雙染料, 可以根據(jù)實驗室條件選擇下列三種方式進 擴增和檢測。

11. 如果使用 PCR 儀、金屬浴或水浴進行擴增,肉眼檢測,則必須先在每個反應管中  30 μL 自備的石蠟油,否則保溫期間反應體系的水分會蒸發(fā),影響反應效率(如 果使用 PCR 儀器并開啟熱蓋,則可以不加石蠟油)。  60-65℃保 90 分鐘,肉 眼觀察管內(nèi)液體顏色。

12. 如果使用熒光定量 PCR 儀:  設為 60-65℃保溫 1 分鐘/循環(huán),   90 個循環(huán),  每分

 


 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

鐘在 FAM 通道采集一次熒光信號。

13. 如使用 PCR 儀、金屬浴或水浴進行擴增,再使用 qPCR 儀進行終點法熒光讀數(shù): 則在擴增前和擴增后,分別在 qPCR 儀器上測熒光讀數(shù)(溫度設為 60-65 ℃,  1 循環(huán),每次循環(huán) 1 分鐘,在 FAM 通道采集一次熒光信號。注意:  測熒光讀數(shù)必 須在 65℃進行)  。擴增反應按 60-65 ℃ ,90 分鐘進行。

   結(jié)果分析及解讀

14. 如果是用普通 PCR 儀器、水浴或金屬浴進行的擴增,反應結(jié)束后只能肉眼判斷結(jié) 果。將反應管放置白色背景(如白紙) 前觀察。擴增陽性對照管內(nèi)反應液將呈現(xiàn) 藍色,無模板和無引物的陰性對照將呈淺藍色。如果擴增陽性對照管內(nèi)反應液不呈 現(xiàn)藍,或無模板和無引物的陰性對照任何一個呈現(xiàn)藍色,則說明試劑有問題,  驗無效。請跟廠家聯(lián)系。

15. 如果實有效,  則分析 N+2 個樣品管的結(jié)果。如果樣品管反應液的顏色接近擴增 陽性對管則說明有擴增,如果接近無模板和無引物的陰性對照,  則說明無擴增。 反應結(jié)果示例見左圖(9 為陰性,  10 為陽性)  。

16. 如果用熒光 PCR 儀進行擴增, 則可分析擴增曲線和 Ct。試劑盒提供的陽性對照  Ct 將小于 60,如果大于 60,說明試劑可能失效,  需跟廠家聯(lián)系。無模板陰性 對照和無引物陰性對照的 Ct 將大于 90。如果任何小于 90,則說明試劑或環(huán)境被 污染,需重復實驗或跟廠家聯(lián)系。如果陽性對照和陰性對照 Ct 都在正常范圍,則 分析樣品的 Ct。Ct 小于 60 的判斷為陽性,大于 90 判為陰性,  在 60-90 之間則 需要重復檢測。

17. 如果使用 PCR 儀、金屬浴或水浴進行擴增,肉眼檢測,再使用熒光定量 PCR  終點法熒光讀數(shù)來判斷陰陽性, 則先比較陽性對照和陰性對照。陽性對照樣品 增后信號增幅應該超過 100%,  陰性對照擴增后信號增幅應該低于 50%,否則 無效, 請與廠家聯(lián)系。如果兩個對照均有效,則比較樣品擴增前后熒光讀數(shù)的 差值。如果擴增后熒光信號增幅低于 50%,則判斷為陰性。如果熒光信號增幅高 100%,則判斷為陽性。熒光信號增幅在 50- 100%之間的,  則需要重測。

18. 當實時熒光檢測和可視化檢測同時用于判讀結(jié)果時,如果彼此不一致, 以實時熒光 LAMP 的數(shù)據(jù)為準。一般可視化結(jié)果滯后實時熒光檢測結(jié)果 20-30 分鐘,也就是 說,在 qPCR 儀上第 30 分鐘時呈現(xiàn)陽性的樣品,  其反應液的顏色變化一般在第

50-60 分鐘時才能觀察到。

關(guān)聯(lián)產(chǎn)品

酸純化病毒保存液,  PCR 級石蠟油

 

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