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五種致瀉性大腸埃希氏菌鑒定試劑盒(PCR法)說(shuō)明書(shū)

來(lái)源:上海晅科生物科技有限公司   2022年04月24日 10:58  

五種致瀉性大腸埃希氏菌鑒定試劑盒(PCR法)說(shuō)明書(shū)

u  產(chǎn)品說(shuō)明

五種致瀉性大腸埃希氏菌鑒定試劑盒PCR法可針對(duì)食品、飼料等樣品中的致病微生物的特異核酸片段進(jìn)行擴(kuò)增,儀器實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增過(guò)程中的熒光信號(hào)變化,自動(dòng)判讀結(jié)果。本產(chǎn)品用于致瀉大腸埃希氏菌的檢測(cè)。檢出限為 10CFU/ml。

    產(chǎn)品組成(96 測(cè)試)

222.png


   所需儀器

ABI ,BioRadTaKaRa 等 PCR 擴(kuò)增儀,電泳儀,凝膠成像儀等電泳配套設(shè)備。使用熒光定量 PCR 儀進(jìn)行定性判讀時(shí)則無(wú)需電泳設(shè)備

   自備耗材和儀器

①滅菌 1.5mL 或 2.0mL 離心管;②冰盒;③移液器0.5-10μL10-100μL,100-1000μL及配套滅菌吸頭;④ 離心機(jī);⑤渦旋混勻器;⑥金屬浴。

   樣品處理

參照《GB4789.6—2016 食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn)致瀉大腸埃希氏菌檢驗(yàn)》中的操作步驟進(jìn)行前增菌。建議使用試劑配套細(xì)菌基因組 DNA 提取系列產(chǎn)品。

   實(shí)驗(yàn)操作

1.試劑配制(試劑配制區(qū),放置于冰盒中進(jìn)行取出各管試劑,將試劑*解凍,離心 30s。取 12×(所待檢樣品數(shù)+3)的 PCR 反應(yīng)管,按 12 個(gè)一組排列并編號(hào),依次向各管中加入 23μ的 12 種反應(yīng)液。

2.添加模板(樣本制備區(qū),放置于冰盒中進(jìn)行向每管反應(yīng)液中分別加入 2μL 模板(或直接使用無(wú)菌吸頭挑取少許待檢菌落至反應(yīng)管中)。加樣示例:(有 個(gè)待測(cè)樣品

(N+3)組 12 個(gè)一組的反應(yīng)管,按順序第一組 12 管中全部加入 2μL 的 NG-DW,第二組 12管中全部加入 2μL的 NG-Ecoli,第三組 12 管中全部加入 2μL 的樣品 模板,第四組 12 管中全部加入 2μL 的樣品 模板,…,最后組 12 管中全部加入 2μL PG-Ecoli。

蓋好 PCR 管蓋后,渦旋混勻 30s,離心 1min,立即進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)。

3.擴(kuò)增反應(yīng)(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū)

按下列條件設(shè)置擴(kuò)增反應(yīng):(如需使用熒光法進(jìn)行檢測(cè)請(qǐng)選擇 FAM 通道

PCR 循環(huán)

熒光收集位點(diǎn)

37

10 分鐘

個(gè)循環(huán)

95℃

10 分鐘

個(gè)循環(huán)

95℃

30 


30 個(gè)循環(huán)

63 ℃

30 

72℃

90 

72℃

分鐘

個(gè)循環(huán)


4.產(chǎn)物電泳(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū)

稱量 4. 0g 瓊脂糖粉,加入至 200 mL 的 1×TAE 電泳緩沖液中,充分混勻。使用微波爐反復(fù)加熱至沸騰,直到瓊脂糖粉*融化形成清亮透明的溶液。待瓊脂糖溶液冷卻至 60右時(shí),加入溴化乙錠EB )至終濃度為 0.5μg/mL, 充分混勻后,輕輕倒入已放置好梳子的模具中,凝膠長(zhǎng)度要大于 10cm,厚度宜為 3mm~5mm。檢查梳齒下或梳齒間有無(wú)氣泡,用一次性吸頭小心排掉瓊脂糖凝膠中的氣泡。當(dāng)瓊脂糖凝膠*凝結(jié)硬化后,輕輕拔出梳子,小心將膠塊和膠床放入電泳槽中,樣品孔放置在陰。向電泳槽中加入 1×TAE 電泳緩沖液,液面高于膠面 1mm~2mm。將5μL PCR 產(chǎn)物與 1μL 6×上樣緩沖液混勻后,用微量移液器吸取混合液垂直伸入液面下膠孔,小心上樣于孔中;陽(yáng)性對(duì)照的 PCR 反應(yīng)產(chǎn)物加入到最后一個(gè)泳道;第一個(gè)泳道中加入 2 μ L 分子量 Marker 。接通電泳儀電源,根據(jù)公式: 電壓=電泳槽正負(fù)極間的距離(cm×5V/cm 計(jì)算并設(shè)定電泳儀電壓數(shù)值;啟動(dòng)電壓開(kāi)關(guān),電泳開(kāi)始以正負(fù)極鉑金絲出現(xiàn)氣泡為準(zhǔn)。電泳 30min~45min 后,切斷電源。取出凝膠放入凝膠成像儀中觀察結(jié)果,拍照并記錄數(shù)據(jù)。

u  可使用 Gold viewGal-Rad 等等效的核酸熒光染料替代 EB。

u  推薦使用 DNA MarkerDL2000 或 100bp ladder,等可指示 100bp~1500bp 條帶的 Marker。

    結(jié)果分析

1.陰陽(yáng)性判讀:

進(jìn)行電泳檢測(cè)時(shí),需對(duì)比 Marker 進(jìn)行判斷,當(dāng)目的靶標(biāo)對(duì)應(yīng)位置出現(xiàn)單一顯著條帶時(shí)可判斷該靶標(biāo)為陽(yáng)性; 否則為該靶標(biāo)檢測(cè)為陰性。使用熒光定量 PCR 儀檢測(cè)時(shí),檢測(cè)孔Ct≤30 時(shí)判斷該孔為陽(yáng)性;當(dāng)檢測(cè)孔Ct30 時(shí), 該檢測(cè)孔為陰性

示例電泳圖


111.png


2.有效性判讀:

需同時(shí)滿足:1.空白對(duì)照中所有泳道均為陰性;2.陰性對(duì)照中 uidA 泳道陽(yáng)性,其余泳道陰性;2.陽(yáng)性對(duì)照中所有泳道陽(yáng)性,此時(shí)可判斷實(shí)驗(yàn)有效。如無(wú)法滿足上述條件,則實(shí)驗(yàn)無(wú)效,需重復(fù)實(shí)驗(yàn);如重復(fù)后結(jié)果仍為無(wú)效,請(qǐng)于本公司技術(shù)支持聯(lián)系。

3.結(jié)果判讀:

在實(shí)驗(yàn)有效的情況下,可根據(jù)下表進(jìn)行判讀:


大腸埃希氏菌類別

目標(biāo)條帶的種類組合

EIEC

ipaH(+)



uidA

(+/-)

EAEC

aggR,astA,pic 中一條或一條以上陽(yáng)性

EPEC

bfpB,eae(+,stx1stx2,

STEC/EHEC

stx1,stx2 中一條或一條以上陽(yáng)性,eae+/-,bfpB-)

ETEC

ltstp,sth 中一條或以上陽(yáng)性

u  97%以上大腸埃希氏菌為 uidA 陽(yáng)性,可參考陰性對(duì)照中該基因檢測(cè)結(jié)果判斷擴(kuò)增效果;

u  當(dāng)結(jié)果判定為EPEC 陽(yáng)性時(shí),若 bfpB 靶標(biāo)為陽(yáng)性則說(shuō)明樣品含有典型EPEC;若 bfpB 靶標(biāo)為陰性則說(shuō)明樣品為非典型EPEC;

當(dāng)結(jié)果判定為STEC/EHEC 陽(yáng)性時(shí),若 eae 靶標(biāo)為陽(yáng)性則說(shuō)明樣品含有典型EHEC;若 eae 靶標(biāo)為陰性則說(shuō)明樣品為非典型EHEC。




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