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Rubicon和Qiagen單細胞全基因組擴增試劑盒的對比
閱讀：2106發(fā)布時間：2017-11-27
一、Rubicon和Qiagen單細胞全基因組擴增試劑盒的對比
品牌 | Rubicon | Qiagen |
產(chǎn)品 | PicoPLEX WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒 | REPLI-g Single Cell Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒 |
技術(shù) | 特殊隨機引物起始的熱循環(huán)擴增+PCR | 多重置換擴增(MDA) |
表現(xiàn) | 中等基因組覆蓋度 中等保真度 低基因丟失率 zui高的重復(fù)性和一致性 | 高基因組覆蓋度 高保真度 高基因丟失率 低重復(fù)性和一致性 |
*應(yīng)用 | 基因拷貝數(shù)變異 (CNV) | 單核苷酸變異(SNV） |
操作細節(jié) | ||
反應(yīng)時間 | 3小時 | 超過8小時 |
擴增DNA產(chǎn)量 | 2-5µg2 | 7-20 µg1，40µg3 |
產(chǎn)物長度 | 0.25–1.0 kb1 | 平均長度 >10 kb3 |
參考：
1.The comparison of the performance of four whole genome amplification kits on ion proton platform in copy number variation detection. Xinyi Zhang et al.
2.Rubicon 資料，RB3050說明書.
3.Qiagen 資料，150343說明書.
紅榮微再編輯整理。
二、產(chǎn)品介紹
Rubicon PicoPLEX WGA Kit單細胞全基因組擴增試劑盒
單管，3步，PicoPlEX WGA試劑盒專門用于人單細胞和pg級DNA的擴增，具有可重復(fù)性、低背景的特點。3小時內(nèi)完成細胞裂解、熱循環(huán)文庫制備和低背景擴增，zui終能得到2-5µg擴增DNA。
技術(shù)原理及特點
利用特殊隨機引物（Quasi-random primer）引發(fā)線性擴增進行全基因組擴增。
相比于以往的PCR、MDA、MALBC為基礎(chǔ)的單細胞全基因組擴增技術(shù)，操作簡單快速。擴增zui大優(yōu)勢：再現(xiàn)性良好。
REPLI-g Single Cell Kit 單細胞擴增試劑盒
REPLI-g Single Cell Kit 單細胞擴增試劑盒采用MDA技術(shù)，可均一的擴增單個細胞（1至1000個細菌或腫瘤細胞）或純化的基因組DNA，能夠覆蓋基因組所有位點。產(chǎn)量穩(wěn)定，可達40 µg（產(chǎn)物平均長度大于>10 kb）。適用于二代測序等新技術(shù)應(yīng)用?？捎糜诎┌Y、干細胞或宏觀基因組學(xué)（metagenomics）研究。
技術(shù)原理及特點
REPLI-g Single Cell Kit 單細胞擴增試劑盒采用多重置換擴增（MDA，Multiple Displacement Amplification）技術(shù)，對所有基因組位點進行無偏差的擴增。與基于PCR的全基因組擴增技術(shù)相比，該技術(shù)具有更好的擴增保真度，避免出現(xiàn)假陽性或假陰性信號。
多重置換擴增(MDA)的恒溫基因組擴增技術(shù)包含了隨機六聚體與變性DNA的結(jié)合過程，以及使用Phi 29聚合酶在恒定溫度下進行的鏈置換合成過程。典型擴增能夠生成40 µg以上的DNA產(chǎn)量，而不受起始模板量影響，這意味著在大多數(shù)應(yīng)用中無需進行額外的DNA濃度檢測，既可直接進行后續(xù)的遺傳學(xué)分析。
溫和的堿變性法
REPLI-g Kit采用溫和堿性孵育法，在DNA斷裂或去堿基化發(fā)生頻率非常低的情況下讓使其均勻地變性。這樣擴增得到的DNA具有非常高的完整性，擴增片段的長度達到zui大化，從而使基因組中的位點和序列都得以均勻呈遞。
訂購信息
品牌 | 貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
Rubicon | RB3050/R30050 | PicoPLEX WGA Kit單細胞全基因組擴增試劑盒，array CGH、PCR分析用 | 50次反應(yīng) |
QIAGEN | 150343 | REPLI-g Single Cell Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒 | 24次/盒 |
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