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數(shù)字PCR在癌癥早篩和微小殘留病灶檢測(cè)的應(yīng)用

時(shí)間:2020/2/15閱讀:2997
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近幾十年的大量研究表明,在許多血液系統(tǒng)惡性腫瘤中,微小殘留病灶(MRD)與臨床結(jié)果及預(yù)后顯著相關(guān)。癌癥中MRD是指癌癥治療達(dá)到*緩解后,用常規(guī)的形態(tài)學(xué)檢測(cè)方法不能檢測(cè)到明顯的癌病灶,而此時(shí)體內(nèi)仍存在的少量癌細(xì)胞。微小殘留病灶是腫瘤復(fù)發(fā)的直接原因。


目前應(yīng)用廣泛精確的MRD檢測(cè)手段是通過取患者的血液,對(duì)其中的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)進(jìn)行檢測(cè),這種方法也叫做液體活檢(liquid biopsy),它可以獲取患者腫瘤病變信息,用以幫助診斷治療。

臨床研究主要是基于聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)的方法對(duì)淋巴疾病的MRD進(jìn)行評(píng)估。一篇描述PCR在淋巴瘤MRD檢測(cè)中的臨床研究由Gribben JG在1991年發(fā)表。隨后又引入了基于TaqMan的實(shí)時(shí)PCR(qPCR),它可以定量分子靶標(biāo)。目前,qPCR是用于MRD檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)化方法,但該方法有一定的局限性,由于MRD本身的特征,常規(guī)的qPCR在檢測(cè)時(shí)往往達(dá)不到理想的效果。

為了克服標(biāo)準(zhǔn)分子技術(shù)的一些缺陷,需要高精度、高通量的MRD檢測(cè)工具,數(shù)字PCR技術(shù)作為第三代PCR技術(shù),在靈敏度以及準(zhǔn)確性度上遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于qPCR。如一篇文章中報(bào)道,研究人員利用數(shù)字PCR以及二代測(cè)序技術(shù)對(duì)淋巴增生性疾病MRD進(jìn)行監(jiān)測(cè),探究其在液體活檢方面的可行性。  

在本篇文章中,研究人員發(fā)現(xiàn)與qPCR相比,數(shù)字PCR在進(jìn)行MRD研究中具有許多實(shí)用優(yōu)勢(shì)。數(shù)字PCR無需依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行樣品定量,可以避免因反應(yīng)效率波動(dòng)而導(dǎo)致的結(jié)果差異,使那些由于診斷時(shí)腫瘤負(fù)荷低而無法生成可靠的標(biāo)準(zhǔn)曲線的患者得以康復(fù)。而且,它可以幫助節(jié)省寶貴診斷時(shí)間。
此外,文章報(bào)道了數(shù)字PCR技術(shù)在其他惡性血液病的MRD評(píng)價(jià)方面取得了較大進(jìn)展。例如,在慢性髓系白血病中,與標(biāo)準(zhǔn)qPCR相比,數(shù)字PCR在低轉(zhuǎn)錄水平樣本的檢測(cè)上更加準(zhǔn)確。
本研究表明,數(shù)字PCR可能會(huì)改變當(dāng)前的MRD監(jiān)測(cè)方法,從而使將來的試驗(yàn)可以更好地表征血液系統(tǒng)疾病,幫助研究人員開發(fā)出MRD檢測(cè)的個(gè)性化方法。法國(guó)Stilla Technologies的Naica微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng),利用cutting-edge微流體創(chuàng)新型芯片—Sapphire芯片作為數(shù)字PCR過程的耗材。樣品通過毛細(xì)通道網(wǎng)格以30,000個(gè)微滴的形式進(jìn)入2D芯片中。并且還是3色熒光檢測(cè)儀器,整個(gè)流程只需要兩個(gè)半小時(shí)。結(jié)合強(qiáng)大的圖像分析技術(shù)和直觀可視的檢測(cè)功能,從而達(dá)到了數(shù)字PCR定量的置信水平,獲得的數(shù)據(jù)真實(shí)可信。

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