ELISA試劑盒為了揭示犬類適應高海拔低氧環(huán)境的遺傳機制,研究組沿青藏高原的茶馬古道采集了六種品系的犬類共計60個樣本,采用全基因組深度測序的方法,總數據量達到6.75T,是迄今zui大的犬類重測序項目。這也是*次揭示藏獒這種世界上zui古老和zui兇猛的犬類的遺傳多態(tài)性。
ELISA試劑盒研究組在不同海拔的犬類的基因組中鑒定到了高度分化的區(qū)域,其中包含的基因如EPAS1和HBB,在人類或其他動物中都與高原低氧的適應性有關。特別是研究組在高海拔犬類的EPAS1基因中發(fā)現了四個全新的氨基酸突變,其中一個發(fā)生在PAS結構域的一個高度保守的位點上。研究組在更大的樣本上驗證了這個突變,并通過與生理指標的關聯分析表明它與血流阻力的降低有關。有趣的是,EPAS1也與藏族人群的高原適應性有關,但是人類中卻沒有鑒定到EPAS1的編碼區(qū)突變。
這些結果表明,高原犬類與高原人群在低氧適應方面存在協同進化,同時也為研究EPAS1在這一適應過程中的作用提供了新的啟示。
ELISA試劑盒該項工作得到了中國科學院、科技部、國家自然科學基金委等項目支持,其中大數據計算部分獲得中國科學院“十二五”信息化專項超級計算重點應用示范項目支持。
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